GEO2Enrichr

Ma'ayan Lab

Co je GEO2Enrichr?

GEO2Enrichr je rozšíření Chrome vyvinuté maayanlabapps, a jeho hlavní funkcí je „Ma'ayan Lab“.

Snímky obrazovky rozšíření

screenshot

Stáhnout soubor CRX rozšíření GEO2Enrichr

Stáhněte si soubory rozšíření GEO2Enrichr ve formátu crx, ručně nainstalujte rozšíření Chrome do prohlížeče nebo sdílejte soubory crx s přáteli, abyste jednoduše nainstalovali rozšíření Chrome.

Pokyny pro Použití Rozšíření

                        Identification of differentially expressed genes is an important step in extracting knowledge from gene expression profiling studies. The raw expression data from microarray and other high-throughput technologies is deposited into the Gene Expression Omnibus (GEO) and served as Simple Omnibus Format in Text (SOFT) files. However, extracting and analyzing differentially expressed genes from GEO requires significant computational skills.

GEO2Enrichr is a browser extension that can be used to extract differentially expressed gene sets from GEO, and analyzing those sets with Enrichr through a user interface. GEO2Enrichr adds functionality to GEO web-pages where with one click, users can submit two groups of samples to our web-server. The server downloads the SOFT files, parses, cleans, and normalizes the data, identifies the differentially expressed genes, and then pipes the resulting gene lists to Enrichr for downstream functional analysis. GEO2Enrichr can help researchers to quickly explore hypotheses with no technical overhead, lowering the barrier of entry for biologists by automating data processing steps needed for knowledge extraction from the major repository GEO.                    

Základní Informace o Rozšíření

Název GEO2Enrichr GEO2Enrichr
ID pcbdeobileclecleblcnadplfcicfjlp
Oficiální URL https://chrome.google.com/webstore/detail/geo2enrichr/pcbdeobileclecleblcnadplfcicfjlp
Popis Ma'ayan Lab
Velikost souboru 155 KB
Počet instalací 1,000
Aktuální Verze 5.0
Poslední Aktualizace 2019-07-06
Datum Vydání 2019-07-06
Hodnocení 5.00/5 Celkem 12 Hodnocení
Vývojář maayanlabapps
E-mail [email protected]
Typ Platby free
Webové stránky Rozšíření https://amp.pharm.mssm.edu/g2e/
Podporované Jazyky en
manifest.json
{
    "update_url": "https:\/\/clients2.google.com\/service\/update2\/crx",
    "name": "GEO2Enrichr",
    "short_name": "g2e",
    "version": "5.0",
    "description": "Ma'ayan Lab",
    "icons": {
        "128": "logo-128x128.png"
    },
    "permissions": [
        "downloads",
        "https:\/\/amp.pharm.mssm.edu\/Enrichr\/"
    ],
    "background": {
        "scripts": [
            "g2e.background.js"
        ],
        "persistent": false
    },
    "content_scripts": [
        {
            "matches": [
                "https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/sites\/*",
                "https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/geo\/query\/acc.cgi*",
                "https:\/\/amp.pharm.mssm.edu\/gen3va\/*"
            ],
            "css": [
                "open-sans.css",
                "main.css",
                "jquery-ui.min.css"
            ],
            "js": [
                "jquery-1.11.2.min.js",
                "jquery-ui.min.js",
                "tag-it.min.js",
                "g2e.js"
            ]
        }
    ],
    "web_accessible_resources": [
        "\/*"
    ],
    "manifest_version": 2,
    "content_security_policy": "script-src 'self' https:\/\/ajax.googleapis.com; object-src 'self'"
}