GEO2Enrichr

Ma'ayan Lab

Co to jest GEO2Enrichr?

GEO2Enrichr to rozszerzenie Chrome opracowane przez maayanlabapps, a jego główną funkcją jest „Ma'ayan Lab”.

Zrzuty ekranu rozszerzenia

screenshot

Pobierz plik CRX rozszerzenia GEO2Enrichr

Pobierz pliki rozszerzeń GEO2Enrichr w formacie crx, zainstaluj ręcznie rozszerzenia Chrome w przeglądarce lub udostępnij pliki crx znajomym, aby łatwo zainstalować rozszerzenia Chrome.

Instrukcja Użytkowania Rozszerzenia

                        Identification of differentially expressed genes is an important step in extracting knowledge from gene expression profiling studies. The raw expression data from microarray and other high-throughput technologies is deposited into the Gene Expression Omnibus (GEO) and served as Simple Omnibus Format in Text (SOFT) files. However, extracting and analyzing differentially expressed genes from GEO requires significant computational skills.

GEO2Enrichr is a browser extension that can be used to extract differentially expressed gene sets from GEO, and analyzing those sets with Enrichr through a user interface. GEO2Enrichr adds functionality to GEO web-pages where with one click, users can submit two groups of samples to our web-server. The server downloads the SOFT files, parses, cleans, and normalizes the data, identifies the differentially expressed genes, and then pipes the resulting gene lists to Enrichr for downstream functional analysis. GEO2Enrichr can help researchers to quickly explore hypotheses with no technical overhead, lowering the barrier of entry for biologists by automating data processing steps needed for knowledge extraction from the major repository GEO.                    

Podstawowe informacje o rozszerzeniu

Nazwa GEO2Enrichr GEO2Enrichr
ID pcbdeobileclecleblcnadplfcicfjlp
Oficjalny URL https://chrome.google.com/webstore/detail/geo2enrichr/pcbdeobileclecleblcnadplfcicfjlp
Opis Ma'ayan Lab
Rozmiar pliku 155 KB
Liczba instalacji 1,000
Aktualna Wersja 5.0
Ostatnia Aktualizacja 2019-07-06
Data Publikacji 2019-07-06
Ocena 5.00/5 Łącznie 12 Oceny
Deweloper maayanlabapps
E-mail [email protected]
Typ Płatności free
Strona Rozszerzenia https://amp.pharm.mssm.edu/g2e/
Obsługiwane Języki en
manifest.json
{
    "update_url": "https:\/\/clients2.google.com\/service\/update2\/crx",
    "name": "GEO2Enrichr",
    "short_name": "g2e",
    "version": "5.0",
    "description": "Ma'ayan Lab",
    "icons": {
        "128": "logo-128x128.png"
    },
    "permissions": [
        "downloads",
        "https:\/\/amp.pharm.mssm.edu\/Enrichr\/"
    ],
    "background": {
        "scripts": [
            "g2e.background.js"
        ],
        "persistent": false
    },
    "content_scripts": [
        {
            "matches": [
                "https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/sites\/*",
                "https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/geo\/query\/acc.cgi*",
                "https:\/\/amp.pharm.mssm.edu\/gen3va\/*"
            ],
            "css": [
                "open-sans.css",
                "main.css",
                "jquery-ui.min.css"
            ],
            "js": [
                "jquery-1.11.2.min.js",
                "jquery-ui.min.js",
                "tag-it.min.js",
                "g2e.js"
            ]
        }
    ],
    "web_accessible_resources": [
        "\/*"
    ],
    "manifest_version": 2,
    "content_security_policy": "script-src 'self' https:\/\/ajax.googleapis.com; object-src 'self'"
}